Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Trex2Q9R1A9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trex2Q9R1A9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms