Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrpxQ9R0M3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrpxQ9R0M3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrpxQ9R0M3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SrpxQ9R0M3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrpxQ9R0M3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SrpxQ9R0M3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms