Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AmfrQ9R049 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AmfrQ9R049 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms