Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Copg1Q9QZE5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Copg1Q9QZE5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms