Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nr2e3Q9QXZ7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms