Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nufip1Q9QXX8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nufip1Q9QXX8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms