Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Apbb1Q9QXJ1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apbb1Q9QXJ1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms