Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MARCH4Q9P2E8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms