Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Csnk1eQ9JMK2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csnk1eQ9JMK2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms