Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gkap1Q9JMB0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gkap1Q9JMB0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms