Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK3

Cabp5, Calcium-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp5Q9JLK3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cabp5Q9JLK3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cabp5Q9JLK3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp5Q9JLK3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp5Q9JLK3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp5Q9JLK3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp5Q9JLK3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp5Q9JLK3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp5Q9JLK3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp5Q9JLK3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cabp5Q9JLK3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp5Q9JLK3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp5Q9JLK3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp5Q9JLK3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp5Q9JLK3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp5Q9JLK3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp5Q9JLK3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp5Q9JLK3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp5Q9JLK3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp5Q9JLK3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp5Q9JLK3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cabp5Q9JLK3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms