Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tlr5Q9JLF7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tlr5Q9JLF7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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