Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc5a3Q9JKZ2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc5a3Q9JKZ2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Slc5a3Q9JKZ2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Slc5a3Q9JKZ2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Slc5a3Q9JKZ2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Slc5a3Q9JKZ2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Slc5a3Q9JKZ2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Slc5a3Q9JKZ2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc5a3Q9JKZ2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a3Q9JKZ2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a3Q9JKZ2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a3Q9JKZ2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a3Q9JKZ2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a3Q9JKZ2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a3Q9JKZ2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a3Q9JKZ2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a3Q9JKZ2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a3Q9JKZ2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a3Q9JKZ2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a3Q9JKZ2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a3Q9JKZ2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Slc5a3Q9JKZ2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc5a3Q9JKZ2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc5a3Q9JKZ2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc5a3Q9JKZ2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Slc5a3Q9JKZ2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms