Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl39Q9JKF7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms