Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pus3Q9JI38 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pus3Q9JI38 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms