Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zcchc17Q9ESX4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zcchc17Q9ESX4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms