Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ropn1Q9ESG2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ropn1Q9ESG2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms