Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
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Usp29Q9ES63 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Usp29Q9ES63 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Usp29Q9ES63 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Usp29Q9ES63 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Usp29Q9ES63 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Usp29Q9ES63 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Usp29Q9ES63 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Usp29Q9ES63 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Usp29Q9ES63 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Usp29Q9ES63 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Usp29Q9ES63 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Usp29Q9ES63 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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