Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW8

Ndst4, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst4Q9EQW8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ndst4Q9EQW8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ndst4Q9EQW8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ndst4Q9EQW8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms