Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r53Q9EP93 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r53Q9EP93 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r53Q9EP93 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r53Q9EP93 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vmn1r53Q9EP93 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r53Q9EP93 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.3 ms