Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mrpl4Q9DCU6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mrpl4Q9DCU6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms