Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pop7Q9DCH2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pop7Q9DCH2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms