Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAX3

Erv3, Endogenous retroviral sequence 3, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erv3Q9DAX3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Erv3Q9DAX3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Erv3Q9DAX3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms