Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms