Protein–RNA interactions for Protein: Q9D753

Exosc8, Exosome complex component RRP43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc8Q9D753 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc8Q9D753 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc8Q9D753 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc8Q9D753 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc8Q9D753 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc8Q9D753 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc8Q9D753 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Exosc8Q9D753 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc8Q9D753 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc8Q9D753 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc8Q9D753 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc8Q9D753 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc8Q9D753 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc8Q9D753 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc8Q9D753 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc8Q9D753 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc8Q9D753 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Exosc8Q9D753 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc8Q9D753 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms