Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nop56Q9D6Z1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nop56Q9D6Z1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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