Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc52a3Q9D6X5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms