Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ribc2Q9D4Q1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ribc2Q9D4Q1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ribc2Q9D4Q1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ribc2Q9D4Q1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ribc2Q9D4Q1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ribc2Q9D4Q1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ribc2Q9D4Q1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ribc2Q9D4Q1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ribc2Q9D4Q1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ribc2Q9D4Q1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ribc2Q9D4Q1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ribc2Q9D4Q1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ribc2Q9D4Q1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ribc2Q9D4Q1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ribc2Q9D4Q1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ribc2Q9D4Q1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ribc2Q9D4Q1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ribc2Q9D4Q1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ribc2Q9D4Q1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ribc2Q9D4Q1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ribc2Q9D4Q1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ribc2Q9D4Q1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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