Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syce1Q9D495 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Syce1Q9D495 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms