Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krtap5-3Q9D226 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krtap5-3Q9D226 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms