Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ifitm1Q9D103 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ifitm1Q9D103 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifitm1Q9D103 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm1Q9D103 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifitm1Q9D103 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms