Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab3bQ9CZT8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab3bQ9CZT8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms