Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cmss1Q9CZT6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cmss1Q9CZT6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms