Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psma8Q9CWH6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psma8Q9CWH6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms