Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atxn3Q9CVD2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atxn3Q9CVD2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms