Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lhfpl3Q9CTN8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lhfpl3Q9CTN8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms