Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nrxn1Q9CS84 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nrxn1Q9CS84 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nrxn1Q9CS84 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nrxn1Q9CS84 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nrxn1Q9CS84 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nrxn1Q9CS84 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nrxn1Q9CS84 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nrxn1Q9CS84 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nrxn1Q9CS84 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nrxn1Q9CS84 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nrxn1Q9CS84 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nrxn1Q9CS84 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nrxn1Q9CS84 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nrxn1Q9CS84 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nrxn1Q9CS84 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nrxn1Q9CS84 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nrxn1Q9CS84 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms