Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klhl28Q9CR40 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl28Q9CR40 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms