Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PsenenQ9CQR7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PsenenQ9CQR7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms