Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccer1Q9CQL2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccer1Q9CQL2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccer1Q9CQL2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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