Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9CQF4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9CQF4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9CQF4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9CQF4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9CQF4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9CQF4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q9CQF4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9CQF4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms