Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atp6v0e1Q9CQD8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Atp6v0e1Q9CQD8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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