Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ70

H2afb1, Histone H2A-Bbd type 1, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb1Q9CQ70 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2afb1Q9CQ70 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
H2afb1Q9CQ70 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms