Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Atg3Q9CPX6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg3Q9CPX6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms