Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkd1Q99MH6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkd1Q99MH6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms