Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epdr1Q99M71 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Epdr1Q99M71 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms