Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cttnbp2nlQ99LJ0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cttnbp2nlQ99LJ0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms