Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cstf3Q99LI7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cstf3Q99LI7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms