Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cds2Q99L43 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms