Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q99KU6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q99KU6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q99KU6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q99KU6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q99KU6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q99KU6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q99KU6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q99KU6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q99KU6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Q99KU6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q99KU6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q99KU6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q99KU6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q99KU6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q99KU6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q99KU6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q99KU6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q99KU6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q99KU6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Q99KU6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q99KU6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q99KU6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q99KU6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q99KU6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Q99KU6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q99KU6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q99KU6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q99KU6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q99KU6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q99KU6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q99KU6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q99KU6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q99KU6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Q99KU6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q99KU6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q99KU6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q99KU6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Q99KU6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q99KU6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q99KU6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Q99KU6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q99KU6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q99KU6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q99KU6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q99KU6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q99KU6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q99KU6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q99KU6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q99KU6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q99KU6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q99KU6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q99KU6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q99KU6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q99KU6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q99KU6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q99KU6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q99KU6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q99KU6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q99KU6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q99KU6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Q99KU6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q99KU6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q99KU6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q99KU6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Q99KU6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q99KU6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q99KU6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q99KU6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Q99KU6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q99KU6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q99KU6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q99KU6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q99KU6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q99KU6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q99KU6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q99KU6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q99KU6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q99KU6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q99KU6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q99KU6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q99KU6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q99KU6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q99KU6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q99KU6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q99KU6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q99KU6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q99KU6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q99KU6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q99KU6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q99KU6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q99KU6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q99KU6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q99KU6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q99KU6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q99KU6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q99KU6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q99KU6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q99KU6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q99KU6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms